基因条形码
DNA条形码(英语:DNA barcoding)是一种利用基因组内的DNA片段来鉴定生物物种的技术。动物物种的鉴定采用线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因(cytochrome c oxidase I, COI)作为通用DNA条形码序列[1];生命条形码联盟(CBOL)植物工作组推荐叶绿体基因组的rbcL和matK片段作为植物鉴定的DNA条形码[2][3];生命条形码联盟真菌工作组推荐核糖体DNA内转录间隔区基因(nuclear ribosomal internal transcribed spacer, ITS)为真菌首选DNA条形码[4]。
一.DNA条形码简介
在DNA分类学的基础上,加拿大动物学家Paul Hebert等对动物界11门13320个物种的线粒体细胞色素C氧化酶亚基基因序列比较分析(除腔肠动物Cnidaria),98%的物种遗传距离差异在种内0% ~2%,种间平均可达到11.3%。据此提出可以用单一的小片段基因来代表物种,作为物种的条形编码,为全球生物编码,即DNA barcoding(DNA条形码)是利用一段标准DNA序列作为标记来实现快速、准确和自动化的物种鉴定。
二.实验流程
三.DNA 条形码技术路线
前期确认阶段:试验样本类型,数量,所用的引物,签订试验合作合同;
试验阶段:(30个工作日)包括选取4-6个样本进行预实验;
四、客户提供:
★ 基因组DNA:
●至少15μL样品,浓度为50-100ng/μL;
●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;
●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;
●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;
●DNA溶解后,肉眼看不到杂色;
★ 植物材料: 新鲜组织,叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;
★ 动物材料: 新鲜组织,无水乙醇封存低温运输;
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