AFLP技术服务

AFLP技术服务

AFLP标记技术是1993年由荷兰的Zabeau和Vos博士提出并完善的。现已广泛应用于生物多样性，指纹图谱的构建，遗传图谱的构建，基因克隆等诸多研究领域，显示了广阔的应用前景。AFLP与其他分子标记相比具有：1、DNA 用量少;2、可重复性好;3、多态性强;4、分辨率高;5、样品适用性广，6、对基因组序列信息依赖性低等优点。在物种的多态性分析中获得广泛的应用。AFLP的选择扩增产物目前主要通过两种方法进行分离检测，传统的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)的方法和自动化程度较高的毛细管凝胶电泳进行检测。

PAGE方法主要是AFLP的选择扩增产物经过聚丙烯酰胺凝胶电泳得到分离，然后通过银染将条带显现出来，然后通过照相得到相应的图片，优点是引物可以是普通引物，价格相对较低，做少量样本或者大量样本的引物筛选比较合适，另外还可以对差异条带进行克隆测序，获得差异条带的序列信息。

毛细管电泳检测方法的优点是自动化，可以对大量样本进行实验，速度快，后期的条带读取可以依靠软件，降低了人为读取的标准不一。

1)AFLP服务内容

1 样本基因组DNA的提取

2 筛选多态性较好的引物(酶切，预扩，选择性扩增)

3-1 在ABI3730xl测序仪上完成数据采集

3-2 或是在JY-CX2B型 测序电泳槽上完成PAGE 检测(可以回收差异带)

4 数据分析：和客户详细沟通，确认分析方案：读取01矩阵(PAGE胶读取另外收费);聚类分析;多样性分析;多态位点数(AP) 、多态位点百分率( P) 、平均等位基因数(N a) 、有效等位基因数(N e) 、Nei′s基因多样性指数(H) 、Shannon′s信息指数( I) 、遗传分化度(Gst)等。利用NTSYS进行聚类分析。

2)目前已经进行的样本类型：树木，草，花卉，昆虫，鱼类，虾类，真菌等;

3)客户提供：

★ 基因组DNA：

●至少15μL样品，浓度为50-100ng/μL;

●2%琼脂糖电泳检测有DNA主带，没有降解;

●DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;

●DNA需溶解在TE或灭菌的去离子水里;

●DNA溶解后，肉眼看不到杂色;

★ 植物材料： 新鲜组织，叶片采用硅胶干燥后或干冰运输;

★ 动物材料： 新鲜组织，无水乙醇封存低温运输;

4)报价体系：